依据国家科技发展方针，围绕国家发展战略目标，针对科学发展前沿和国家重大需求，以农业有益微生物的利用和有害微生物的防治为主要研究内容，深入开展农业微生物学的应用基础研究，并向基础研究和应用开发两个方面延伸。力求将实验室建成本领域特色鲜明、国内领先，并具有国际影响力的农业微生物学重点实验室。